1月7日下午，2009年亚冠小组抽签揭晓。上海申花队分在G组，与韩、日联赛冠军水源三星、鹿岛鹿角，以及附加赛的胜者同组。

　　对于此次抽签分组，上海申花俱乐部董事长周军表示“：对于抽签的结果，我们并没有什么特殊的感受，因为从我们的角度来讲，能够参加亚冠的球队都是强队，被分到哪个小组都需要我们在每场比赛中拼尽全力，我们从来没有想过什么‘理想签位’。另外，投资人和董事局对球队的投入是以亚冠级别来进行配置的，这样的支持力度是前所未有的，我们对亚冠的态度就是真正为申花、为中国的荣誉而战斗，投资人和董事局已经下了“小组出线”的死命令，如果申花队在2009年亚冠联赛的小组比赛中不能获得出线，那么作为董事长，我将第一个提出辞职！每一个申花人都会像我一样以‘敢于承担责任’的态度面对2009的亚冠征战！男人的肩膀就是用来扛起责任的，最后的荣誉也是需要用责任来做担保的！”

　　对于董事长周军的军令状，上海申花俱乐部投资人朱骏表示：“接受董事长周军的军令状，投资人和董事局将尽最大所能向球队投入人力、物力和精力。”