第一阶段资格赛（2007年10月--11月）

　　报名参加南非世界杯预选赛的亚洲球队共43支，除德国世界杯五个参赛队澳大利亚、韩国、伊朗、日本、沙特外，其他38队全部参加资格赛。

　　按德国世界杯预选赛成绩（上届是以国际足联排名为依据），第36位至第43位的8支球队为一组，第28至第35位的8支球队为另一组，这两个组于10月份两个国际足联比赛日进行第一轮主客场交叉淘汰赛。获胜的8支球队再加上排名第21至第27位的7支球队共15支队伍合成一组，排名第6位至第20位的15支球队为另一个组（中国队排名第10），这两个小组再进行第二轮交叉淘汰赛，时间是11月的两个国际足联比赛日。最终取胜的15支球队将获得参加第二阶段小组赛的资格。

　　第二阶段资格赛（2008年2月开始）

　　2007年11月23日，这15支通过资格赛的球队，再加上5支世界杯参赛队，共20支球队将参加在南非德班举行的世界杯预选赛分组抽签仪式。届时，这20支球队分为五个小组，5支德国世界杯参赛队为种子队，每组4队进行主客场循环赛，小组前两名出线，最终10支球队获十强赛资格。

　　第三阶段十强赛（2009年）

　　2009年，10支球队分成两组，每组5队进行主客场循环赛。每组积分前两名将直接获得南非世界杯决赛阶段参赛资格，两组的第三名进行主客场附加赛，获胜球队将与大洋洲冠军进行主客场制交锋，最终的胜者也将参加南非世界杯赛。

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